北京基因组所与北京协和医院合作展现胰腺癌肿瘤-微情形高度异质性细胞特征
胰腺导管腺癌（PDAC）被称为“癌中之王” ，早期诊断难题、治疗效果欠佳、病死率居高不下 ，五年生涯率仅为8.5% ，具有很强的肿瘤异质性。为解决生命与康健领域重大医学科学前沿问题 ，2018年 ，中科院—北京协和医院康健科学研究中心建设。由赵玉沛院士、周琪院士担当科学照料 ，中科院北京基因组研究所杨运桂团队、韩鼎力大举团队与北京协和医院吴文铭团队在康健科学研究中心支持下 ，为探讨PDAC爆发生长的分子机制以及肿瘤微情形的调控作用 ，通过合作研究 ，使用单细胞转录组测序手艺 ，系统判断并剖析了PDAC病人和比照胰腺样本细胞类型 ，剖析了胰腺癌肿瘤-微情形高度异质性特征 ，展现了肿瘤亚群细胞与浸润免疫细胞间相互关系 ，提出了新的潜在治疗靶点。
研究团队通过对24例术前未经放化疗的人胰腺癌组织的41986个细胞及11例比照胰腺组织的15544个细胞举行单细胞转录组剖析 ，绘制了大样自己胰腺导管腺癌细胞图谱。首先 ，通过t-SNE 剖析判断出胰腺癌组织中10类细胞：I型导管细胞、II 型导管细胞、腺泡细胞、内渗透细胞、内皮细胞、成纤维细胞、星型细胞、巨噬细胞、T细胞和B细胞。通过CNV团结差别剖析和功效富集 ，判断II型导管细胞是胰腺癌组织的恶性细胞。其次 ，使用轨迹剖析研究了PDAC从癌前状态到恶性状态的基因表达模式 ，发明在PDAC希望历程中 ，包括ErbB和Notch信号通路在内的多个经典致癌通路被激活。特殊是在肿瘤希望的晚期 ，细胞增殖和迁徙的相关基因被显著激活。另外 ，团队在II型导管细胞中判断出具备高增殖、高转移潜能等在内的七个细胞亚群。其中 ，亚群7（增殖性导管亚群）的特征基因富集在细胞周期和细胞增殖相关通路。进一步 ，团结TCGA数据库的PAAD数据集举行整合剖析发明 ，肿瘤组织中增殖性导管细胞亚群特征基因的表达水平与肿瘤浸润T细胞的激活保存显著的负相关性 ，病理切片染色也证实晰这两群细胞数目的关联性 ，提醒增殖性导管细胞的保存和活化T细胞的缺失可能配合导致PDAC患者的不良预后。
相关研究效果在7月4日以Single-cell RNA-seq highlights intra-tumoral heterogeneity and malignant progression in pancreatic ductal adenocarcinoma为题在Cell Research杂志在线揭晓。
该研究为探索胰腺导管腺癌的致病机制、展现肿瘤微情形的作用提供了主要的组学资源 ，展现了增殖性导管亚群抑制 T 细胞浸润和活化的新机制 ，提出了CDK1 ，PLK1和AURKA等增殖性导管亚群标记物作为精准治疗靶点的可行性 ，为胰腺癌精准诊治提供了新的研究偏向。该研究获得了4001老百汇网站战略性先导科技专项、国家重点研发妄想、中国医学科学院医学与康健科技立异工程、国家自然科学基金等基金资助。
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胰腺癌肿瘤-微情形高度异质性细胞特征
