北京基因组所混淆性白血病基因组研究获希望
克日,4001老百汇网站王前飞研究员与美国芝加哥大学血液学教授Michael J. Thirman合作开展的“MLL融合卵白在急性白血病中的致病机制研究”取得阶段性希望,其研究论文《MLL融合卵白在白血病基因组中选择性调控MLL野生型的部分靶基因》(MLL Fusion Proteins Preferentially Regulate a Subset of Wild Type MLL Target Genes in the Leukemic Genome),于2011年4月在BLOOD杂志揭晓。该项效果的宣布展现了MLL融合卵白通过选择性调控野生型MLL卵白的部分靶基因而推动急性白血病爆发的致病机制,为我国白血病及其肿瘤基因组研究起到了起劲推动意义。
MLL白血病是一类预后不良的血液系统恶性肿瘤,由于染色体易位形成MLL融合卵白而得名。野生型MLL(Mixed Lineage Leukemia)基因编码一种组卵白甲基转移酶,通过催化H3K4甲基化而激活一系列在血细胞分解和发育历程中起要害作用的基因表达。染色体易位后形成的MLL融合卵白通过召募组卵白甲基转移酶DOT1L来催化H3K79甲基化,引起全基因组转录表达的杂乱。然而,失衡的转录组中哪些是MLL融合卵白的直接靶基因和要害的致病通路,现在尚未有较系统和周全的研究。
为了叙述这一主要问题,王前飞研究员及着实验室成员通过接纳两套平行计划,即较量人源白血病细胞系的MLL团结、团结剖析可诱导MLL-ENL小鼠模子的靶基因定位与表达谱,发明了MLL融合卵白团结的靶基因是野生型MLL卵白靶基因的一部分(图A)。研究还发明,在诱导MLL-ENL小鼠模子中,MLL融合卵白的团结与H3K79甲基化水平的改变仅局限于部分基因组区域,并由此界定了223个MLL-ENL团结的靶基因。令人受惊的是,在诱导爆发MLL-ENL融合卵白后,MLL融合卵白团结的绝大部分靶基因没有显示出mRNA表达水平的显著改变;只有12个靶基因的mRNA水平显著升高,被界说为MLL-ENL调控靶基因。这些要害的靶基因中除了已知的HOXA9/MEIS1, 研究还发明了转录因子EYA1、SIX1和SIX4是MLL-ENL的直接靶点,并且EYA卵白已知能与SIX卵白家族成员形成异二聚体,因此提醒了EYA1/SIX1很可能是急性白血病中MLL融合卵白介导的一种新的致病通路。研究职员进一步通过造血细胞转化实验证实晰EYA1与SIX1协同作用能使造血祖细胞在体外永生化(图B)。
总之,该研究展现了MLL融合卵白通过选择性调控野生型MLL卵白的部分靶基因而推动急性白血病爆发的致病机制,批注晰EYA1/SIX1很可能是急性白血病中MLL融合卵白介导的一种新的致病通路,为深入开展白血病的转录调控机理研究涤讪了优异基础。现在,该实验室正综合运用ChIP-seq和RNA-seq系统研究MLL白血病中要害的microRNA靶基因和相关的转录调控网络,并对MLL白血病病人举行全基因组重测序。期望团结实验血液学以及强盛的基因组学手艺平台,解读正常与白血病基因组,并由此加深对人类癌症的理论熟悉,为设计分子手段治疗血癌提供可能的靶点。
论文链接:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21518926